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实施项目的组织结构对能否获得项目所需资源和以何种条件获取资源起着制约作用。组织结构一般有三种类型：职能型、矩阵型和项目型。矩阵型可进一步划分为弱矩阵、平衡矩阵和强矩阵。不同组织结构的区别如下表所示。
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很多组织在不同的组织层级上用到上述所有的结构，这种组织通常被称为复合型组织。例如，在典型的职能型组织中建立专门的项目团队来实施重要的项目；又如，组织采用强矩阵结构管理其大多数项目，而小项目则采用职能型结构管理。
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在生成项目组织结构图之前，高层管理者和项目经理必须明白什么类型的人才真正是保证项目的关键人物，他们需要什么样的技能。如果需要找一些优秀的Java开发人员，人力资源计划就需要反映这个需求；如果项目成功的关键是需要一流的项目经理和被人尊敬的团队领导，人力资源计划也要重点描述。
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在已经明确项目所需要的重要技能和何种类型的人员的基础上，项目管理师应该为项目创建一个项目组织结构图。在许多人参加项目的情况下，清晰的定义和项目工作的分配是十分必要的。
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结构化设计方法中使用结构图来描述系统的体系结构，指出一个系统由哪些模块组成，以及模块之间的调用关系。结构图的基本成分有：模块、调用和数据。
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在结构化设计中，模块指具有一定功能并可以用模块名调用的一组程序语句，如函数、子程序等，它们是组成程序的基本单元。
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一个模块具有外部特征和内部特征。模块的外部特征包括：模块的接口（模块名、输入／输出参数、返回值等）和模块功能。模块的内部特征包括：模块的内部数据和完成其功能的程序代码。
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在结构图中，模块用矩形表示，并用名字标识该模块，名字应体现该模块的功能。
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结构图中模块之间的调用关系用从一个模块指向另一个模块的箭头来表示，其含义是前者调用了后者。
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模块间还经常用带注释的短箭头表示模块调用过程中来回传递的信息。箭头尾部带空心圆的表示传递的是数据，带实心圆的表示传递的是控制信息，如下图所示。
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可以在结构图上添加一些辅助符号进一步描述模块间的调用关系。如果一个模块是否调用一个从属模块决定于调用模块内部的判断条件，则该调用模块间的判断调用采用菱形符号表示；如果一个模块通过其内部循环的功能来循环调用一个或多个从属模块，则该调用称为循环调用，用弧形箭头表示。判断调用和循环调用的表示方法如下图所示。
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