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按水印的特性可以将数字水印分为鲁棒数字水印和易损数字水印。
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鲁棒数字水印主要用于在数字作品中标识著作权信息，利用这种水印技术在多媒体内容的数据中嵌入创建者、所有者的标示信息，或者嵌入购买者的标示（即序列号）。在发生版权纠纷时，创建者或所有者的信息用于标示数据的版权所有者，而序列号用于追踪违反协议而为盗版提供多媒体数据的用户。用于版权保护的数字水印要求有很强的鲁棒性和安全性，除了要求在一般图像处理（如滤波、加噪声、替换、压缩等）中生存外，还需能抵抗一些恶意攻击。
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易损数字水印（Fragile Watermarking）与鲁棒数字水印的要求相反，易损数字水印主要用于完整性保护，这种水印同样会在内容数据中嵌入不可见的信息。当内容发生改变时，这些水印信息会发生相应的改变，从而鉴定原始数据是否被篡改。易损数字水印应对一般图像处理（如滤波、加噪声、替换、压缩等）时有较强的免疫能力（鲁棒性），同时又要求有较强的敏感性，即既允许一定程度的失真，又要能将失真情况探测出来；它必须对信号的改动很敏感，人们根据易损数字水印的状态可以判断数据是否被篡改过。
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按水印所附载的媒体可以将数字水印分为图像水印、音频水印、视频水印、文本水印以及用于三维网格模型的网格水印等。随着数字技术的发展，会有更多种类的数字媒体出现，同时也会产生相应的水印技术。
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按水印的检测过程可以将数字水印分为明文水印和盲水印。明文水印在检测过程中需要原始数据，而盲水印的检测只需要密钥，不需要原始数据。一般来说，明文水印的鲁棒性比较强，但其应用会受到存储成本的限制。目前学术界研究的数字水印大多数是盲水印。
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按水印的内容可以将数字水印分为有意义水印和无意义水印。有意义水印是指水印本身也是某个数字图像（如商标图像）或数字音频片段的编码；无意义水印则只对应于一个序列号。有意义水印的优势在于，如果其由于受到攻击或其他原因致使解码后的水印破损，人们仍然可以通过视觉观察确认是否有水印。但对于无意义水印来说，如果解码后的水印序列有若干码元错误，则只能通过统计决策确定信号中是否含有水印。
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不同的应用需求造就了不同的水印技术。按水印的用途可以将数字水印分为票证防伪水印、版权保护水印、篡改提示水印和隐蔽标识水印。
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票证防伪水印是一类比较特殊的水印，主要用于打印票据、电子票据、各种证件的防伪。一般来说，伪币的制造者不可能对票据图像进行过多的修改，所以诸如尺度变换等信号编辑操作是不用考虑的。但在另一方面，人们必须考虑票据破损、图案模糊等情况，而且考虑到快速检测的要求，用于票证防伪的数字水印算法不能太复杂。
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版权标识水印是目前研究最多的一类数字水印。数字作品既是商品又是知识作品，这种双重性决定了版权标识水印主要强调隐蔽性和鲁棒性，而对数据量的要求相对较小。
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篡改提示水印是一种脆弱水印，其目的是标识原文件信号的完整性和真实性。
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隐蔽标识水印的目的是将保密数据的重要标注隐藏起来，限制非法用户对保密数据的使用。
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按数字水印的隐藏位置可以将其分为时（空）域数字水印、频域数字水印、时／频域数字水印和时间／尺度域数字水印。时（空）域数字水印直接在信号空间上叠加水印信息，而频域数字水印、时／频域数字水印和时间／尺度域数字水印则分别是在DCT变换域、时／频变换域和小波变换域上隐藏水印。
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随着数字水印技术的发展，各种水印算法层出不穷，水印的隐藏位置也不再局限于上述四种。应该说，只要构成一种信号变换，就有可能在其变换空间上隐藏水印。
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