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系统制作与集成是指利用多媒体编著工具以及有关技术方法实现数据集成和媒体拼接的整合工作。这项工作是整个流程中难度最大、要求最高的工作，目前一般采用以下两种方法。
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这些工具好学易用，集成多媒体数据简单方便，不需要太多的编程知识，可以节约不少人力资源，提高生产效率。但这种工具的灵活性较差，在追求电子出版物的风格和效果时常会感到力不从心。专业的电子出版社由于涉及的电子出版物数量巨大、种类繁多，一般采用该方法。
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目前常用的高级程序语言有C++、Visual Basic、Java等，直接利用计算机语言进行开发可以比较灵活地实现创作意图和功能要求，但是对系统集成人员的技术要求很高，必须是精通计算机语言的技术人员才能得心应手。计算机公司较多采用这种方法，并在实际操作过程中有针对性地开发符合自己需要的技术平台，以提高效率、降低成本。
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